2022年3月3日,國(guó)家基因庫(kù)于生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)(CNGBdb)發(fā)布生菜綜合數(shù)據(jù)庫(kù)(LettuceDB),旨在為生菜科研與育種工作提供全面的數(shù)字化資源。LettuceDB的上線將進(jìn)一步深化“種質(zhì)→核酸→數(shù)據(jù)”三位一體的核心種質(zhì)基因庫(kù)模式在農(nóng)業(yè)智慧育種中的創(chuàng)新轉(zhuǎn)化和產(chǎn)業(yè)應(yīng)用。
LettuceDB作為全球大型生菜種質(zhì)基因資源數(shù)據(jù)庫(kù),提供生菜栽培及野生育種的多組學(xué)數(shù)據(jù),未來將包含3000+份生菜數(shù)據(jù)資源。本次發(fā)布的V1.0版本包括450份生菜資源的2億條基因變異信息,同時(shí)提供生菜及野生近緣種的基因數(shù)據(jù)和種質(zhì)信息。 LettuceDB V2.0版計(jì)劃發(fā)布2500多份數(shù)據(jù),同時(shí)還將建設(shè)多組學(xué)數(shù)據(jù)模塊和基因組育種模塊,依托基因組資源大數(shù)據(jù),支撐生菜精準(zhǔn)育種與我國(guó)蔬菜種業(yè)振興。 未來,結(jié)合種質(zhì)資源與測(cè)序數(shù)據(jù),國(guó)家基因庫(kù)將建成“一站式”的功能基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),為植物遺傳資源智慧育種提供支持,促進(jìn)植物遺傳資源在糧食和農(nóng)業(yè)等方面的研究與應(yīng)用。 |